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湖北快三走势图:最新研究:华南海鲜市场非新冠病毒起源地,11月中下旬已人传人-佳木斯新闻

【北京新增2例】

and transmissions of the novel pneumonia coronavirus (SARS-CoV-2) using whole

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genomic data(基于全基因组数据解码新型冠状病毒进化和传播)的论文(1月21日重新提交)◇。

科研人员收集了全世界各领域共享到GISAID

论文根据新型冠状病毒基因组数据推算2月12日之前发生了两次明显种群扩张⌒♂〇。1月之前的种群扩张发生时间是12月8日♂♂↑,该结果暗示病毒可能在12月初♀△π,甚至11月中下旬即已经开始有人际传播π,随后在华南海鲜市场加快了人际传播〇?□。研究推算2月份之前的种群扩张时间在1月6日♀,这个可能与元旦假期有关联⌒∴⊿。

单倍型或其衍生的单倍型(H2◇,H8-H12)△◇┊,这表明市场上短期内存在传播感染﹡。华南市场中的新冠病毒可能是从其他地方传播的﹡↑△,或者至少华南市场没有病毒的原始来源⊿。由于最早确定的受感染患者与市场没有联系□♂♀,受感染的人很可能将新冠病毒传播给市场上的工人或卖家⊙⊙↑,然后迅速在市场上流通π↑。拥挤的市场加速了病毒传播给买家∵,并于2019年12月上旬传播到整个城市▽∵☆,这与估计的人口扩张时间相对应◇。

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论文分析93个新冠病毒完整基因组

论文指出♂,这一天国家疾控中心发布了2级应急响应△∟∴。当时的预警起到了一些警示作用◇,公众活动和出行都有所减少△π▽。如果当时的警示能引起大众更广泛的重视∵∵↑,那么1月份中下旬向全国和全球蔓延的病例会有所降低△♂π。研究人员进一步确认我国其他9个省区和其他11个国家的感染病例基本都是从武汉直接或者间接输入而来〇⊙☆。

研究发现π♂,收到的93个样本包含58种单倍型(可以理解为核酸链上决定同一性状的多个连锁基因构成的基因型)◇┊,可以归纳为五组⌒,包括3个古老超级传播者单倍型(H1,H3和H13)和2个新的超级传播者单倍型(H56和mv2)∴┊。其中▽,在中国样本中发现31个单倍型♂,在其他国家样本中发现31个单倍型π。

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中科院西双版纳热带植物园副研究员郁文彬等人1月19日在中科院科技论文预发布平台chinaxi提交了一篇名为Decoding the evolution

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H3 单倍型只有一个来自武汉的样本□⊙┊,与华南市场没有联系♂☆,而含有H3的其他样本则来自其他国家和地区◇▽♂。值得注意的是π,华南市场的所有样本均具有 H1

论文解释□,可能是因为现有样品主要采自几家定点医院↑∟⌒,而且样品采集时间局限于2019年12月24日和2020年1月5日♂⊙□。如果能在武汉其他医院早期的病患检测到这两种单倍型⌒π,将对于寻找病毒来源非常有帮助□。

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<  现在扩散的病例至少来自于3个途径▽∴〇。

单倍型H13和H38的病毒样品溯源发现分别是来自深圳的病患(广东首例)和美国华盛顿州的病患(美国首例)♂。他们的旅行记录表明应该都是2019年12月底至2020年1月初在武汉探亲期间被感染的⊿?π。但现有武汉样本中没有检测到H13和H38单倍型▽□♂。

科研人员最新研究成果显示▽◇▽,武汉华南海鲜市场不是新冠病毒的起源地〇?,新冠病毒可能最早于去年11月中下旬就输入武汉∵♀◇,并开始人际传播┊┊◇,在华南海鲜市场加快了人际传播⊙。现在扩散的病例至少来自于3个途径∵﹡﹡。新型冠状病毒在2月12日之前发生过2次明显的种群扩张(分别是12月8日和1月6日)〇⌒。

全文2016字▽,阅读约需4分钟

EpiFluTM数据库中覆盖了四大洲12个国家的93个新型冠状病毒样本的基因组数据(截至2月12日)☆,通过全基因组数据解析◇,追溯传染源及扩散路径□☆⊿。

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研究发现﹡□,与华南海鲜市场有关联的患者样品单倍型都是H1及其衍生的单倍型H2□﹡,H8-H12⊿,而一份武汉样品单倍型H3与华南海鲜市场无关◇△〇。

研究人员发现新型冠状病毒基因组没有发生重组事件∟⊙﹡,但有基因组之间有突变♂??,这种突变是否会影响新型冠状病毒的活性暂不清楚☆⌒,需要其他蛋白组学和结构生物学方面的专业人士进行验证△。

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武汉华南海鲜批发市场华南市场的新型病毒是从其他地方传入的

柳叶刀1月24日在线发表的一项研究显示◇▽,首例新型冠状病毒肺炎确诊患者于去年12月1日发病┊△,且无华南海鲜市场暴露史π。当时这项研究分析了2019年12月16日至2020年1月2日期间在武汉市入院的首批41例确诊感染新型冠状病毒的病例♂♂⌒。结果显示∴,首批41例确诊病例中?⊿,27例去过华南海鲜市场┊♀π,14例没有华南海鲜市场暴露史⌒♀∴。

单倍型演化关系显示♂♂,单倍型H13和H38是比较“古老的”单倍型□,通过一个中间载体(mv1?π,可能是一个祖先单倍型┊π,可能是来自中间宿主或者“零号病人”)与蝙蝠冠状病毒RaTG13关联⊿┊,并通过单倍型H3衍生出了单倍型H1♂♀。

其中┊,广东深圳一家人在早期就通过人传人进行了传播△π。有较多样本的澳大利亚、法国、日本和美国﹡▽,他们的患者感染源至少有两个〇♀∵,尤其是美国包括了五个来源⊙?。非常值得关注的是H56这个超级传播者单倍型〇?,它同时是澳大利亚、法国和美国┊〇◇,以及我国台湾患者的传染源∟♂﹡。

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郁文彬对媒体解释说∟,这是一种基于种群遗传学的分析方法◇。一种基因型不等于一个患者⊿,一种新冠病毒单倍型携带者有可能是多人□,甚至可能是上百人□,比如H1单倍型就对应了19个样本↑∟∴,但是可以通过这个来溯源♀,因为某个单倍型患者意味着可能是来自同一个源传染⊙π♂。

广东的病毒可能有三个来源为了能够细分来源♂,研究人员将58种单倍型分成了五组┊,分别是3个中心(古老超级传播者)单倍型(H1,H3和H13)和2个新的超级传播者单倍型(H56和mv2)⊿♀。以此鉴别出广东的病毒可能有三个来源△⌒,重庆和台湾的病毒有两个来源□。

根据病患发病时间记录和种群扩张时间推断﹡,也印证了华南海鲜市场不是病毒发源地的推论▽。

11月中下旬已有人际传播⊿,病毒基因组没有发生重组

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